Abbiamo parlato di recente di PyMOL, <<software libero di grafica 3D utilizzato per la rappresentazione di biomolecole in biochimica e bioinformatica>>.
Vediamo un tema simile, dal sito ufficiale nvidia.com, l'azienda NVIDIA (di cui abbiamo già parlato, oggi fra i top al mondo in ambito IA) ha sviuppato il framework BioNeMo ( vedi GitHub), che si presenta come una collezione di strumenti, librerie e modelli finalizzati alla ricerca medica e farmacologica. NVIDIA ha deciso di renderlo open-source, come dichiarato: <<NVIDIA Opens BioNeMo to Scale Digital Biology for Global Biopharma and Scientific Industry>>.
Nello specifico, oltre alla visualizzazione 3D analoga a PyMOL di cui avevo già parlato, BioNeMo strutta strumenti di Intelligenza Artificiale per apprendimento automatico, quindi l'uso dell'IA in ambito biomolecolare (all'interno del progetto BioNeMo, i vari sottoservizi: AlphaFold2, DiffDock 2.0, RFdiffusion e ProteinMPNN, link ai servizi direttamente utilizzabili online - li linko e basta, capire bene come funzionino lo lascio a voi 😅). Vista l'importanza e utilità del settore, anche altre aziende stanno contribuendo ad ampliare e finanziare il progetto.
Infine un'immagine rappresentativa, della visualizzazione 3D con BioNeMo, tratta dal sito ufficiale.
Lato visualizzazione 3D, sembra simile a PyMOL, anche es. per il formato file che gestisce (.pdb). Interessanti poi le funzionalità di apprendimento automatico per fare scoperte e ricerche più avanzate. Questo nello specifico non ho avuto modo di testarlo, sono sicuro che lo farete voi 😉 nel complesso mi sembra un progetto utiel e interessante per la ricerca biomedica e farmacologica. Conoscevate il progetto, cosa ne pensate?
